Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d4D3YUH6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms