Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm17333C6EQI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm17333C6EQI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Gm17333C6EQI3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm17333C6EQI3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm17333C6EQI3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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