Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nxpe3B9EKK6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nxpe3B9EKK6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms