Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd8B9EJ80 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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