Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11cB4XVP9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms