Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pnldc1B2RXZ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms