Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc11B2RXC1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms