Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cspp1B2RX88 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cspp1B2RX88 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms