Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf3B2RUQ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usf3B2RUQ2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms