Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrt4B2RU40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt4B2RU40 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms