Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfc3h1B2RT41 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfc3h1B2RT41 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms