Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r5B2RQT2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r5B2RQT2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms