Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf3B2RQG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms