Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H60cB1B213 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H60cB1B213 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60cB1B213 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms