Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ssxb8B1AY40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb8B1AY40 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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