Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trabd2bB1ATG9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms