Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spocd1B1ASB6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spocd1B1ASB6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms