Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr29B1ARI9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr29B1ARI9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms