Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms