Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Skint5A7XUY5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skint5A7XUY5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms