Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Atp8b5A3FIN4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp8b5A3FIN4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Atp8b5A3FIN4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Atp8b5A3FIN4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Atp8b5A3FIN4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp8b5A3FIN4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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