Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatsperbA2RTF1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatsperbA2RTF1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms