Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl41A2AUC9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms