Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf2A2AT37 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms