Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb1A2AQ07 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms