Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c4A2ANA3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms