Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GabreA2AMW3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms