Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FocadA2AKG8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FocadA2AKG8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms