Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Frmpd1A2AKB4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms