Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc4a11A2AJN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc4a11A2AJN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms