Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Frmpd4A2AFR3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms