Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm16A2A935 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms