Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtprfA2A8L5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms