Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms