Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms