Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv13-2A0A140T8N6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-2A0A140T8N6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms