Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms