Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms