Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700028J19RikA0A0U1RP08 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms