Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms