Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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