Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn2aA0A0J9YTW6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn2aA0A0J9YTW6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms