Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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