Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv30A0A0B4J1P1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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