Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv1A0A0B4J1G7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv1A0A0B4J1G7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv1A0A0B4J1G7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv1A0A0B4J1G7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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