Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20792A0A087WRF5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20792A0A087WRF5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms