Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms