Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rnft1Q9DCN7 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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