Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Ccdc18Q640L5 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms