Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms